Die Zweijährige Fachschule stellt nach der Einjährigen Fachschule Agrarwirtschaft (EFA) das zweite Fortbildungsjahr nach Abschluss der Berufsausbildung dar und baut auf den Grundlagen der EFA auf. Während in der EFA noch die Befähigung zur selbstständigen Leitung eines landwirtschaftlichen Betriebs im Fokus stand, zielt die Zweijährige Fachschule auf die Schaffung von Unternehmerpersönlichkeiten ab. Dazu werden die Fähigkeiten vermittelt, ein Unternehmen in allen seinen Aspekten zu analysieren und auf dieser Grundlage langfristige, strategische Entscheidungen zur Unternehmensentwicklung zu treffen und zu beurteilen. Dies erfolgt wie bereits in der EFA in den Bereichen Produktionstechnik (Pflanzenbau, Tierhaltung), Betriebswirtschaft, Unternehmensführung, Marketing und Mitarbeiterführung. Es wird zudem die Ausbildereignung erworben als Grundlage zur Zulassung als Ausbildungsbetrieb. Die Inhalte werden in der Michelsenschule anwendungsbezogen vermittelt, sowohl im Klassenraum als auch im Rahmen von Acker- und Betriebserkundungen sowie Exkursionen.

Der erfolgreiche Abschluss der ZFA befähigt die Absolventinnen und Absolventen, ein eigenes Unternehmen zu führen, Leitungstätigkeiten im vor- und nachgelagerten Bereich zu übernehmen sowie an landwirtschaftlichen Förderprogrammen teilzunehmen. Weiterhin wird die Fachhochschulreife erworben. Der Abschluss berechtigt zudem gemäß § 39 Abs. 2 Nr. 4 HSG zum vollwertigen Studium an allen Hochschulen, inkl. Universitäten (berufliche Hochschulzugangsberechtigung).